Кафедра клинической фармакологии основана в 1987 году. С момента основания и по настоящее время заведует кафедрой Заслуженный деятель науки РФ, Заслуженный врач РФ, доктор медицинских наук, профессор, академик РАН Владимир Иванович Петров.
В сентябре 1991 года при кафедре клинической фармакологии, реаниматологии и интенсивной терапии открыт курс ФУВ «Клиническая фармакология». В сентябре 1998 года на кафедре открыт курс ФУВ «Аллергология и иммунология».
С 2020 года кафедра реорганизована и носит название «Кафедра клинической фармакологии и интенсивной терапии». Весомый вклад в становление и развитие кафедры внесли: Татьяна Павловна Мухина, Александр Георгиевич Вознесенский, Наталия Вячеславовна Рогова.