Кафедра анатомии человека основана в 1935 году одновременно с открытием Сталинградского медицинского института. Её основателем и первым заведующим стал профессор Сергей Николаевич Касаткин (1901–1988) - выдающийся отечественный анатом, доктор медицинских наук,
заслуженный деятель науки РСФСР.
С 1973 по 1995 годы кафедрой руководил профессор Василий Яковлевич Липченко - ученик С.Н. Касаткина, крупный специалист в области морфологии кровеносной и лимфатической систем и иммуноморфологии. Под его руководством кафедра стала междисциплинарным центром, сочетавшим развитие классической анатомии с физикоматематическими методами исследования сосудов. Именно в этот период укрепилась учебно-методическая школа кафедры, издавались учебные пособия и атласы, активно развивались связи с клиническими кафедрами и морфологическими обществами.
С 1995 по 2020 годы кафедрой заведовал профессор Александр Иванович Краюшкин. В этот период произошло интенсивное интегрирование учебной, научной и издательской деятельности кафедры с другими подразделениями университета и профильными кафедрами медицинских вузов России. Сформированы и развиты научные направления в области лимфологии, иммуноморфологии, стоматологической анатомии, артерио- и ангиоархитектоники, функциональной анатомии глаза и гинекологической анатомии.