Материалы к защите диссертации: Шубникова Елена Владимировна

Информация о диссертации
Кандидатская диссертация
Шубникова Елена Владимировна
«Влияние физико-химических факторов и форм адаптивной изменчивости на чувствительность патогенных буркхольдерий к химиотерапевтическим препаратам»
03.02.03 - Микробиология
медицинские науки
21.2.005.06
Волгоградский государственный медицинский университет
400131, Волгоград, пл.Павших Борцов, 1 ВолгГМУ
Предполагаемая дата защиты диссертации: 19 июня 2015 года
[Полный текст диссертации (2.9 Мбайт)] (Опубликован: 11 марта 2015 года)
[Автореферат диссертации (800 кбайт)]
Дата публикации объявления 17 апреля 2015 года
Объявление о защите опубликовано на сайте ВАК:
[Текст объявления] [Версия для печати]
Отзывы на диссертацию *
Научный руководитель
В.И. Илюхин, заслуженный деятель науки РФ, профессор, доктор медицинских наук, главный научный сотрудник лаборатории диагностики и химиотерапии ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора
Скачать отзыв (5.3 Мбайт)
Опубликован: 11 марта 2015 года
Официальный оппонент
Водопьянов С.О., заведующий лабораторией ФКУЗ «Ростовский научно-исследовательский противочумный институт», д.м.н.
Скачать отзыв (418 кбайт)
Опубликован: 8 июня 2015 года
Официальный оппонент
Попов Юрий Алексеевич, д.б.н., профессор ФКУЗ Российский научно-исследовательский противочумный институт Микроб, заведующий отделом образоательных программ и подготовки специалистов
Скачать отзыв (2.9 Мбайт)
Опубликован: 8 июня 2015 года
Ведущая организация
Светоч Эдуард Арсеньевич, доктор ветеринарных наук, профессор, заведующий отделом молекулярной микробиологии
Скачать отзыв (939 кбайт)
Опубликован: 8 июня 2015 года
Отзыв на автореферат
Зинич Л.С., зав. отделом эпидемиолгии ФГКУЗ ПЧС Республики Крым Роспотребнадзора, к.м.н.
Скачать отзыв (846 кбайт)
Опубликован: 8 июня 2015 года
Отзыв на автореферат
А.Н. Куличенко, директор ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, д.м.н., профессор
Скачать отзыв (2.1 Мбайт)
Опубликован: 8 июня 2015 года
Отзыв на автореферат
Миронова Лилия Валерьевна, к.м.н., заведующая лабораторией холеры ФКУЗ Иркутский ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Скачать отзыв (1 Мбайт)
Опубликован: 16 июня 2015 года
Отзыв на автореферат
Н.А. Осина, заведующая лабораторией молекулярной диагностики ФКУЗ Российский НИИ противочумный институт Микроб Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, к.б.н.
Скачать отзыв (3.7 Мбайт)
Опубликован: 18 июня 2015 года
* Убедительная просьба к лицам, присылающим в совет отзывы на автореферат и диссертацию, высылать текст отзыва в формате Adobe PDF на электронную почту совета: ladav52@mail.ru.

Решения диссертационного совета

ВЫПИСКА из протокола № 2  заседания Диссертационного совета Д 208.008.06 ГБОУ ВПО «Волгоградский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения РФ от 14 апреля 2015 года

Присутствовало: 18 членов Диссертационного Совета из 23, утвержденных ВАК РФ в составе Совета. 

Слушали: заключение членов комиссии доктора медицинских наук, профессора Замараева В.С., доктора медицинских наук профессора Яковлева А.Т., доктора медицинских наук, профессора Осадшую Л.Б. по рассмотрению диссертации Шубниковой Елены Владимировны на тему: «Влияние физико-химических факторов и форм адаптивной изменчивости на чувствительность патогенных буркхольдерий к химиотерапевтическим препаратам», представленной на соискание ученой степени кандидата медицинских наук по специальности 03.02.03 – Микробиология (заключение прилагается).

Постановили:  

1.Принять к защите диссертацию Шубниковой Е.В. «Влияние физико-химических факторов и форм адаптивной изменчивости на чувствительность патогенных буркхольдерий к химиотерапевтическим препаратам», представленную на соискание ученой степени кандидата медицинских наук по специальности 03.02.03 – Микробиология.

2. Утвердить в качестве официальных оппонентов:

- заведующего отделом образовательных программ и подготовки специалистов ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб» Роспотребнадзора, доктору биологических наук, профессора Попова Юрия Алексеевича, г.Саратов

 - Заведующего лабораторией биохимии микробов Федеральное казенное учреждение здравоохранения Ростовский-на-Дону противочумный институт Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, доктора медицинских наук Водопьянова Сергея Олеговича, г.Ростов-на-Дону

3. Утвердить в качестве ведущей организации ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, Московская обл.

4. Разрешить печатание и рассылку автореферата диссертационной работы.

5. Утвердить дату защиты 19 июня 2015 года.

Председатель диссертационного совета д.м.н., профессор Клаучек С.В. 

Ученый секретарь диссертационного совета д.с.н., профессор Ковалёва М.Д.

 

Протокол № 2 заседания диссертационного совета Д 208.008.06 от 19.06.2015

Состав диссертационного совета утвержден в количестве 23 человек. Присутствовали на заседании 18 человек.

Председатель: д.  Клаучек Сергей Всеволодович

Присутствовали: д.  Крамарь Вера Сергеевна, д. , д.  Гавриков Леонид Константинович, д. , д.  Губанова Екатерина Ивановна, д.  Давыденко Людмила Александровна, д.  Осадшая Людмила Борисовна, д. , д.  Замараев Валерий Семенович, д.  Липницкий Анатолий Васильевич, д.  Крамарь Олег Григорьевич, д.  Филатов Борис Николаевич, д.  Клаучек Сергей Всеволодович, д.  Клаучек Валентина Васильевна, д.  Храпова Наталья Петровна, д. биол.наук, профессор, д. пед.наук, профессор Солопов Игорь Николаевич, д. мед.наук, профессор Сливина Людмила Петровна, д.  Яковлев Анатолий Трофимович, д.  Краюшкин Сергей Иванович, д.  Попов Александр Сергеевич, д. Латышевская Наталья Ивановна

Официальные оппоненты по диссертации: д. биол.наук, профессор Попов Юрий Алексеевич, д. мед.наук Водопьянов Сергей Олегович

Ведущая организация: Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии

Слушали: Председателя диссертационного совета Д 208.008.06 Клаучека С.В., председателя счетной комиссии Яковлева А.Т.

Постановили: диссертация Шубниковой Е.В. является законченной научно-квалификационной работой, что соответствует критериям, установленным п.9 «Положения о порядке присуждения ученых степеней...». Присудить Шубниковой Е.В. ученую степень кандидата медицинских наук по специальности 03.02.03 Микробиология.

Результаты голосования: «за» - 18, «против» - 0.

Председатель совета Клаучек Сергей Всеволодович
Ученый секретарь совета Ковалева Марина Дмитриевна

 

ЗАКЛЮЧЕНИЕ ДИССЕРТАЦИОННОГО СОВЕТА Д 208.008.06 на базе ГБОУ ВПО «Волгоградский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации по диссертации на соискание ученой степени кандидата наук

аттестационное дело №_________________

решение диссертационного совета от 19.06.2015 г. № 2

О присуждении Шубниковой Елене Владимировне, гражданке Российской Федерации, учёной степени кандидата медицинских наук.

Диссертация «Влияние физико-химических факторов и форм адаптивной изменчивости на чувствительность патогенных буркхольдерий к химиотерапевтическим препаратам» по специальности 03.02.03 Микробиология, принята к защите 14 апреля 2015 г., протокол № 2, диссертационным советом Д 208.008.06 на базе Государственного бюджетного образовательного учреждения высшего профессионального образования (ГБОУ ВПО) «Волгоградский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российский Федерации, 400131, г. Волгоград, пл. Павших борцов, 1, (Приказ № 1925-1358 от 09 сентября 2009 г., с изменениями  состава совета от 22.10.2010 г., № 2472-984/591, действующий на период действия номенклатуры специальностей научных работников).

Соискатель, Шубникова Елена Владимировна, 1981 года рождения. В 2008 году окончила ГОУ ВПО «Волгоградский государственный медицинский университет» Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию. В 2013 г. окончила заочную аспирантуру   на базе Волгоградского научно-исследовательского противочумного института   лаборатории сапа и мелиоидоза, работает в должности научного сотрудника лаборатории сапа и мелиоидоза Федерального казенного учреждения здравоохранения (ФКУЗ) «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека.   Диссертация выполнена в лаборатории сапа и мелиоидоза ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора.

Научный руководитель: заслуженный деятель науки РФ, доктор медицинских наук, профессор Илюхин Владимир Иванович, ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора,

Официальные оппоненты:

1. Попов Юрий Алексеевич - доктор биологических наук, профессор, заведующий отделом образовательных программ и подготовки специалистов, ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора;

2. Водопьянов Сергей Олегович - доктор медицинских наук, заведующий лабораторией биохимии микробов, ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора,

 - дали положительные отзывы на диссертацию.

Ведущая организация: Федеральное бюджетное учреждение науки «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии», пос. Оболенск, Серпуховского района, Московской области,  в своем положительном заключении, подписанном Светочем Эдуардом Арсеньевичем, доктором ветеринарных наук, профессором, заведующим отделом молекулярной микробиологии указала, что диссертационная работа Шубниковой Е.В. является законченным научно-квалификационным исследованием, в котором содержится решение актуальной научной задачи – оценка терапевтической эффективности химиопрепаратов для лечения сапа и мелиоидоза, что имеет важное значение для микробиологии  и полностью соответствует требованиям п. 9 Положения ВАК РФ

       Соискатель имеет 16 опубликованных работ, в том числе, по теме диссертации - 14 работ, опубликованных в рецензируемых научных изданиях - 6, имеется два патента на изобретение (общий объём научных работ составляет 1,4 печатных листа).

Наиболее значительные работы:

Илюхин, В.И. Проблемы соответствия антибиотикочувствительности in vitro и эффективности химиотерапии инфекций, вызванных патогенными буркхольдериями / В.И. Илюхин, Т.В. Сенина, Е.В. Шубникова, Ю.В. Антонов, Н.В. Андропова // Антибиотики и химиотерапия. - 2009. - № 7-8. - C. 19-23.

Ряпис, Л.А. Сравнительная характеристика буркхольдерий группы Pseudomallei / Л.А. Ряпис, В.И. Илюхин, Т.В.Сенина, Е.В. Шубникова, А.А. Будченко, А.С. Куликова // Журн. микробиол. эпидемиол. иммунобиол. - 2013. - № 1. - С.3-8.

Сенина, Т.В. Мелиоидоз: основные этапы научных исследований / Т.В. Сенина, Е.В. Шубникова // Проблемы особо опасных инфекций, вып. 3, 2014. - С. 61-64.

На диссертацию автореферат поступили отзывы от: Зинич Л.С., к.м.н., зав. эпидемиологической лабораторий Противочумной станции Республики Крым Роспотребнадзора; Куличенко А.Н., д.м.н., профессора, директора Ставропольского научно-исследовательского противочумного института; Мироновой Л.В., к.м.н., зав. лабораторией холеры Иркутского научно-исследовательского института Сибири и Дальнего Востока; Осиной Н.А., к.б.н., зав. лабораторией молекулярной диагностики Российского научно-исследовательского противочумного института «Микроб». Отзывы положительные, подтверждают актуальность представленной работы, обоснованность полученных выводов, практическую и научно-теоретическую значимость результатов исследования. Критических замечаний в отзывах не содержится. 

Выбор официальных оппонентов и ведущей организации обосновывается тем, что все официальные оппоненты являются известными специалистами в области микробиологии, в ведущей организации занимаются проблемами теоретической и практической микробиологии.                                          

Заключение

Диссертационный совет отмечает, что на основании выполненных соискателем исследований:

разработаны экспериментальные подходы, касающиеся определения антибиотикочувствительности патогенных буркхольдерий в условиях моделирующих характер взаимодействия химиопрепаратов с микроорганизмами in vivo, позволяющие повысить ценность прогноза эффективности рекомендуемых химиотерапевтических средств;

получены новые данные, дополняющие существующие критерии выбора и оценки терапевтической эффективности антибактериальных препаратов для лечения заболеваний вызываемых патогенными буркхольдериями;

предложены научно-обоснованные подходы к определению чувствительности патогенных буркхольдерий к химиотерапевтическим препаратам и отбору наиболее эффективных из них для адекватной терапии сапа и мелиоидоза. Приоритет подтвержден патентом № 2404252 от 27.04.2009 г. «Способ подбора высокоактивного антибактериального средства для лечения заболеваний, вызываемых патогенными буркхольдериями», в котором предложен способ применения химиотерапевтического средства (меропенема) для экстренной профилактики и лечения острой формы сапа. Терапевтическая эффективность липосомальной формы меропенема доказана при моделировании экспериментального сапа на золотистых хомячках. Приоритет подтвержден патентом на изобретение № 2490013 от 06.07.2012 г. «Способ лечения экспериментального сапа».

Теоретическая значимость исследования обоснована тем, что:

доказаны положения, вносящие вклад в расширение представлений о возможных причинах низкой терапевтической эффективности некоторых применяемых при лечении сапа и мелиоидоза антибактериальных препаратов при сравнительно высокой их активности in vitro;

применительно к проблематике диссертации результативно использован комплекс существующих базовых методов исследования – микробиологических, микроскопических, биологических, позволивших провести комплексную оценку чувствительности четырех видов бурхольдерий (B. mallei, B. pseudomallei, B. cepacia, B. thailandensis) к химиопрепаратам в стандартных условиях и условиях, моделирующих характер взаимодействия микроорганизма с макроорганизмом;

изложены факты, позволяющие считать оценку влияния физико-химических факторов на уровень чувствительности буркхольдерий к химиотерапевтическим препаратам целесообразной, а выявленные различия в показателях чувствительности при определении ее в условиях максимально приближенных к процессу, происходящему в макроорганизме (в физиологических диапазонах меняющихся температуры и рН среды, при добавлении 10 % крови к питательной среде и культивировании в атмосфере с 5 % СО2), коррелирующие с активностью препаратов in vivo,  дают возможность отобрать наиболее эффективные из них для проведения адекватного лечения заболеваний, вызываемых патогенными буркхольдериями;

доказана способность изученных видов буркхольдерий к образованию биопленок на абиотических поверхностях в условиях in vitro. Проведена сравнительная оценка антибиотикочувствительности планктонных и биопленочных культур буркхольдерий. Установлено, что B. mallei и B. pseudomallei в составе зрелых биопленок высокорезистентны к химиотерапевтическим препаратам, применяемым при лечении сапа и мелиоидоза. Все изученные препараты были не активны против зрелых мелиоидозных биопленок, а в отношении сформированных биопленок сапных культур был эффективен меропенем. Выявлена ингибирующая активность антибактериальных препаратов на ранних стадиях образования культурами биопленок;

изучена чувствительность к химиотерапевтическим средствам буркхольдерий, персистирующих в эукариотических клетках. Проведена оценка уровня резистентности буркхольдерий, защищенных клетками тетрахимен и макрофагов, позволяющая считать наиболее перспективным препаратом для лечения - меропенем.

Показана высокая эффективность экстренной профилактики и лечения острого экспериментального сапа липосомальными формами меропенема.

Значение полученных соискателем результатов исследования для практики подтверждается тем, что: материалы диссертации вошли в методические указания МУ 4.2.2787-10 «Методы контроля. Биологические и микробиологические факторы. Лабораторная диагностика мелиоидоза» (утверждены Руководителем Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека 06.12.2010 г.); разработаны «Методические рекомендации по созданию селективных сред для возбудителей сапа и мелиоидоза», утвержденные директором ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора (протокол №10 от 29.12.2010 г.).

Материалы диссертационной работы используются при проведении курса лекций и практических занятий отделом подготовки специалистов при ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора.

Оценка достоверности результатов исследования выявила:

результаты экспериментальных исследований получены на сертифицированном и прошедшем метрологическую проверку оборудовании, опыты проведены в необходимой повторности, материал подвергнут статистической обработке, выводы построены на проверенных данных и фактах;

теория, лежащая в основе диссертационного исследования, построена на известных базовых положениях противомикробной химиотерапии, методах оценки чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам и подбора наиболее эффективных из них для проведения адекватного лечения инфекционных заболеваний;

идея оценки влияния ряда факторов на чувствительность микроорганизмов, в том числе и буркхольдерий, к химиотерапевтическим препаратам, базируется на анализе и обобщении данных, полученных отечественными и зарубежными учеными о возможных причинах низкой терапевтической эффективности химиопрепаратов достаточно активных в опытах in vitro;

использовано сравнение авторских данных и данных, полученных ранее по рассматриваемой тематике;

установлено качественное совпадение авторских результатов с результатами, представленными в независимых источниках по данной тематике;

использованы современные методики сбора и обработки информации.

Личный вклад соискателя состоит в проведении научных экспериментов и получении научных результатов, изложенных в диссертации. Подготовка основных публикаций по выполненной работе осуществлена как лично автором, так и при ее участии.

Диссертация охватывает основные вопросы поставленной научной проблемы и соответствует критерию внутреннего единства, что подтверждается наличием последовательного плана исследования, основной идейной линии, внутренней логики и взаимосвязи выводов.

На заседании 19 июня 2015 г. диссертационный совет принял решение присудить Шубниковой Е.В. учёную степень кандидата медицинских наук.

При проведении тайного голосования диссертационный совет в количестве 18 человек, из них 6 докторов наук по специальности 03.02.03 – Микробиология, участвовавших в заседании, из 23 человек, входящих в состав совета, проголосовали: «за» присуждение учёной степени – 18, «против» присуждения ученой степени – нет, недействительных бюллетеней - нет.

Председатель диссертационного совета  Д 208.008.06, д.м.н., профессор Клаучек Сергей Всеволодович

и.о. учёного секретаря диссертационного совета Д 208.008.06, д.м. н., доцент Осадшая Людмила Борисовна

19.06.2015 г.