Главная страница »» Новости сайта »» Студенты изучают методы компьютерного моделирования лекарств

Лента новостей

Студенты изучают методы компьютерного моделирования лекарств

На кафедре фармакологии и биоинформатики студенты учатся искать новые фармакологически активные вещества с помощью компьютерного моделирования. Одну из студенческих работ в данном направлении представили на VI Международной научно-практической конференции «Беликовские чтения» в городе Пятигорск.

Студенты четвертого курса Дарья Шамшина и Андрей Руднев, а также новый участник их команды – первокурсник Андрей Иванов, представили доклад, посвященный результатам их исследования. Он назывался «k-кратная перекрестная валидация в определении достоверности компьютерной методики ZINDO/1. Подтверждение данными in vitro». Что это значит?

Исследователи оценили способность большого количества новых производных нитразолопиримидина, предоставленных Уральским федеральным университетом, связывать ионы металлов (хелацию). Ранее мы писали, что эти молекулы могут предопределять развитие таких патологических состояний, как болезни Паркинсона или Альцгеймера, а также грозных сосудистых и неврологических осложнений сахарного диабета. Для оценки хелации использовали только компьютер – студенты воспроизвели методику, позволяющую на виртуальной модели изучить процесс связывания металла веществом.

Андрей Иванов с удовольствием поделился математическими аспектами: «Нашим инструментом была методика компьютерного моделирования ZINDO/1. Она основана на уравнении Шредингера и позволяет оценить, как сильно связывается металл с веществом. Работа с ней требует понимания большого количества квантовых величин: мультиплетность спина электронов, факторы перекрывания орбиталей, ядерная энергия, энергия электронов и так далее (подробно это описано в самой работе – прим. автора). Мы также работали с термодинамическими показателями: энтропия, энергия Гельмгольца, теплота, выделяющаяся при формировании комплексного соединения. А математика нужна для того, чтобы не вслепую работать с методом виртуального анализа данных».

Чтобы убедиться, что прогноз действительно верен, Дарья Шамшина провела исследование in vitro ряда соединений, случайно отобранных из обсчитанной соавторами выборки. Она добавляла вещества к растворам, содержащим ионы меди, после чего оценивала скорость распада аскорбиновой кислоты (чувствительной к ионам меди). Студентка подтвердила, что исследуемые соединения замедляют разрушение аскорбиновой кислоты. Успех Дарья комментирует осторожно: «Конечно же, наверняка пройдет еще не одно десятилетие, пока мы сможем так наладить виртуальные фармакологические исследования, что они будут точно имитировать процессы, протекающие в живом организме. Но, пока что, мы стараемся воспроизвести отдельные этапы реализации механизма действия веществ, способных замедлять развитие осложнений диабета и тяжелых нейродегенеративных изменений, в патогенезе которых может играть роль повышение концентраций меди и железа».

Роман Литвинов
фотография предоставлена автором

08.02.18 09:38; Опубликовал: Илья Моисеев; Рубрика: Новости науки ВолгГМУ; Просмотров: 815; CTR: 0.09%;
Подразделение: Кафедра фармакологии и биоинформатики


Авторизуйтесь ВКонтакте, чтобы иметь возможность оставить комментарий на этой странице.
Сервис комментариев, опросов предоставлен сайтом ВКонтакте. Модерация сообщений проводится два раза в сутки.
Мнение посетителей может не совпадать с точкой зрения администрации ВолгГМУ.

Личный кабинет

Контактная информация

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Волгоградский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации

400131, Россия, г. Волгоград,
площадь Павших Борцов, д. 1

Телефон: +7 (8442) 38-50-05
Приёмная комиссия: +7 (8442) 53-23-33
Foreign Department: +7 (8442) 38-30-28

http://www.volgmed.ru
1, Pavshikh Bortsov Sq., Volgograd,
400131, Russian Federation

Статистика посещений

Яндекс.Метрика
Copyright © 2007-2018 Волгоградский государственный медицинский университет - Все права защищены